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  1. 1
    Absolute Protein Binding Free Energy Simulations for Ligands with Multiple Poses, a Thermodynamic Path That Avoids Exhaustive Enumeration of the Poses
    von Sakae, Yoshitake
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2020)
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  2. 2
    Computing conformational free energy differences in explicit solvent An efficient thermodynamic cycle using an auxiliary potential and a free energy functional constructed from the end points
    von Harris, Robert C
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2017)
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  3. 3
    Large-scale asynchronous and distributed multidimensional replica exchange molecular simulations and efficiency analysis
    von Xia, Junchao
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2015)
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  4. 4
    Conformational populations of ligand-sized molecules by replica exchange molecular dynamics and temperature reweighting
    von Okumura, Hisashi
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2010)
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  5. 5
    Asynchronous replica exchange for molecular simulations
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  6. 6
    Integrated Modeling Program, Applied Chemical Theory (IMPACT)
    von Banks, Jay L
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2005)
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  7. 7
    AGBNP an analytic implicit solvent model suitable for molecular dynamics simulations and high-resolution modeling
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  8. 8
    The SGB/NP hydration free energy model based on the surface generalized born solvent reaction field and novel nonpolar hydration free energy estimators
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