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    Ingenuity in performing replica permutation How to order the state labels for improving sampling efficiency
    von Fukuhara, Daiki
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2023)
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  2. 2
    Replica sub-permutation method for molecular dynamics and monte carlo simulations
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  3. 3
    Rapid QM/MM approach for biomolecular systems under periodic boundary conditions Combination of the density-functional tight-binding theory and particle mesh Ewald method
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  4. 4
    Simulated tempering based on global balance or detailed balance conditions Suwa-Todo, heat bath, and Metropolis algorithms
    von Mori, Yoshiharu
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2015)
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  5. 5
    Transformation between α-helix and β-sheet structures of one and two polyglutamine peptides in explicit water molecules by replica-exchange molecular dynamics simulations
    von Chiang, Hsin-Lin
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2014)
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  6. 6
    On-the-fly reconstruction of free-energy profiles using logarithmic mean-force dynamics
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  7. 7
    Hamiltonian replica-permutation method and its applications to an alanine dipeptide and amyloid-β(29-42) peptides
    von Itoh, Satoru G
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2013)
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  8. 8
    Coulomb replica-exchange method handling electrostatic attractive and repulsive forces for biomolecules
    von Itoh, Satoru G
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2013)
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  9. 9
    Conformational populations of ligand-sized molecules by replica exchange molecular dynamics and temperature reweighting
    von Okumura, Hisashi
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2010)

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  10. 10
    Multibaric-multithermal ensemble molecular dynamics simulations
    von Okumura, Hisashi
    Veröffentlicht in: Journal of computational chemistry (2006)
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