A new FFT-based algorithm to compute Born radii in the generalized Born theory of biomolecule solvation

In this paper, a new method for calculating effective atomic radii within the generalized Born (GB) model of implicit solvation is proposed, for use in computer simulations of bio-molecules. First, a new formulation for the GB radii is developed, in which smooth kernels are used to eliminate the div...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Journal of computational physics. - 1986. - 227(2008), 24 vom: 20. Dez., Seite 10162-10177
1. Verfasser: Cai, Wei (VerfasserIn)
Weitere Verfasser: Xu, Zhenli, Baumketner, Andrij
Format: Aufsatz
Sprache:English
Veröffentlicht: 2008
Zugriff auf das übergeordnete Werk:Journal of computational physics
Schlagworte:Journal Article