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Journal Article
4
reweighting
metadynamics
3
Research Support, Non-U.S. Gov't
2
Aptamers, Nucleotide
1
C137DTR5RG
1
Ligands
1
plus ...
Proteins
1
Research Support, N.I.H., Extramural
1
Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
1
Theophylline
1
accelerated molecular dynamics
1
alchemical free energy calculation
1
binding pose
1
collective variable
1
enhanced sampling
1
free energy
1
free energy calculations
1
free energy landscape
1
grid calculations
1
molecular dynamics
1
protein folding
1
standard free energy
1
umbrella sampling
1
weighted histogram analysis
1
moins ...
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1
Alchemical free energy calculations via metadynamics Application to the theophylline-RNA aptamer complex
par
Tanida, Yoshiaki
Publié dans:
Journal of computational chemistry
(2020)
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2
Sampling free energy surfaces as slices by combining umbrella sampling and metadynamics
par
Awasthi, Shalini
Publié dans:
Journal of computational chemistry
(2016)
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3
Accelerated molecular dynamics simulations of protein folding
par
Miao, Yinglong
Publié dans:
Journal of computational chemistry
(2015)
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4
Calculation of free energy landscapes a histogram reweighted metadynamics approach
par
Smiatek, Jens
Publié dans:
Journal of computational chemistry
(2011)
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