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1
SPANA Spatial decomposition analysis for cellular-scale molecular dynamics simulations
von
Yu, Isseki
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2024)
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Acceleration of generalized replica exchange with solute tempering simulations of large biological systems on massively parallel supercomputer
von
Jung, Jaewoon
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Journal of computational chemistry
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3
New parallel computing algorithm of molecular dynamics for extremely huge scale biological systems
von
Jung, Jaewoon
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2021)
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4
Role of the N-Terminal Transmembrane Helix Contacts in the Activation of FGFR3
von
Matsuoka, Daisuke
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2020)
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Scaling molecular dynamics beyond 100,000 processor cores for large-scale biophysical simulations
von
Jung, Jaewoon
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2019)
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6
Multiple program/multiple data molecular dynamics method with multiple time step integrator for large biological systems
von
Jung, Jaewoon
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2017)
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7
Flexible fitting to cryo-EM density map using ensemble molecular dynamics simulations
von
Miyashita, Osamu
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2017)
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8
GENESIS 1.1 A hybrid-parallel molecular dynamics simulator with enhanced sampling algorithms on multiple computational platforms
von
Kobayashi, Chigusa
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2017)
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9
Replica state exchange metadynamics for improving the convergence of free energy estimates
von
Galvelis, Raimondas
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2015)
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10
Midpoint cell method for hybrid (MPI+OpenMP) parallelization of molecular dynamics simulations
von
Jung, Jaewoon
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2014)
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11
Multidimensional umbrella sampling and replica-exchange molecular dynamics simulations for structure prediction of transmembrane helix dimers
von
Li, Pai-Chi
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2014)
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12
Efficient lookup table using a linear function of inverse distance squared
von
Jung, Jaewoon
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2013)
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13
Analysis of lipid surface area in protein-membrane systems combining Voronoi tessellation and Monte Carlo integration methods
von
Mori, Takaharu
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2012)
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14
Geometrically associative yet electronically dissociative character in the transition state of enzymatic reversible phosphorylation
von
Re, Suyong
Veröffentlicht in:
Journal of computational chemistry
(2011)
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